Après des études de piano et d'accompagnement au CNR de Boulogne-Billancourt, Samuel Jean a étudié avec Serge Zapolsky au CNSM de Paris dans la classe d'accompagnement-direction de chant, dont il sort diplômé avec mention Très Bien en 2002.
Attiré par la direction d'orchestre, il obtient en 2004 un premier prix à l'unanimité dans la classe de Stéphane Cardon en C.N.R de Boulogne-Billancourt.
En décembre 2006, il est lauréat de l'audition des jeunes chefs de l'Orchestre National d'Ile de France.
Il débute sa carrière de chef en 2005, à l'Opéra Comique, en dirigeant La Veuve Joyeuse de Léhar, mise en scène par Jérôme Savary pour plus de 30 représentations.
En 2006-2007, il est l'assistant à la direction musicale et chef de chœur pour Le Chanteur de Mexico au Théâtre du Châtelet, notamment avec l'Orchestre Philharmonique de Radio-France, dirige de nouveau La Veuve Joyeuse puis La Périchole à l'Opéra Comique et au Teatro Verdi de Trieste. Il est invité par Radio France pour diriger un concert d'ensembles vocaux (concert diffusé sur France Musique), et par l'Orchestre de Pau Pays de Béarn pour un concert au Zénith.
Enfin, il dirige plusieurs représentations de la création de Damon Albarn Monkey : Journey to the West au Festival International de Manchester et au théâtre du Châtelet.
En 2007-2008, il dirige l'Orchestre National d'Ile de France dans deux programmes, notamment à la salle Pleyel, mais aussi l'Orchestre de Rouen Haute-Normandie (Histoire du Soldat de Stravinsky), l'Orchestre Symphonique Régional du Limousin (Requiem de Mozart) et l'Orchestre de Pau Pays de Béarn (La Périchole d'Offenbach). Il est également assistant à l'Opéra National de Montpellier (Zauberflöte de Mozart, Niquet / Scarpitta), à l'Opéra Comique (Roméo et Juliette de Dusapin, Altinoglu / Lagarde) et au Théâtre du Châtelet (Véronique de Messager, Spinosi / Ardant).
Samuel fait ses débuts à Milan (Auditorium) en dirigeant en juin 2008 La Périchole d'Offenbach à la tête de l'Orchestre Giuseppe Verdi.
Dans le cadre du Festival des Pierres Lyriques, il dirige à l'été 2008 La Belle Hélène d'Offenbach avec l'Orchestre de Pau - Pays de Béarn.
En septembre 2008, Samuel Jean est l'assistant de John Nelson pour La Damnation de Faust avec l'Orchestre de la Suisse Romande au Grand Théâtre de Genève. En décembre 2008, Samuel assure avec un grand succès la direction de représentations de On the Town de Bernstein au Châtelet (Paris).
En janvier 2009, il dirige la création de l'opéra Affaire étrangère de Valentin Villenave à l'Opéra National de Montpellier (avec entr'autre Viorica Cortez…) très bien accueillie par le public et mal presse.
En avril 2009, Samuel dirige une série de concerts avec Pierre et le Loup de Prokofiev, avec l'Orchestre de Haute Normandie (narrateur : Benjamin Lazar) à Rouen, puis en mai, il revient à la tête de l'Orchestre National d'Ile de France pour une tournée de concerts en Ile de France.
En juin / juillet 2009, il participe au Festival d'Aix en Provence à la nouvelle production d'Orphée aux Enfers qu'il dirigera lors des reprises en tournée de ce spectacle en 2010 et 2011 à l'Opéra de Toulon, au Duo de Dijon et au Grand Théâtre d'Aix en Provence.
En octobre 2009 Samuel fait ses débuts à la tête de l'Orchestre Philarmonique de Radio France, puis retourne en décembre à l'Orchestre National de Montpellier pour des concerts symphoniques.
Auparavant (novembre / décembre) Samuel sera retourné à l'Opéra National de Montpellier pour la création de l'opéra de Gérard Calvi La Cantatrice Chauve basée sur la célèbre pièce d'Ionesco.
Au printemps 2010, Samuel fait ses débuts avec l'Orchestre d'Avignon et des Pays de Vaucluse pour un programme concertant et symphonique, puis il dirigera en juin, L'IIe de Tulipatan d''Offenbach, dans une nouvelle production de l'Opéra de Rouen Haute Normandie.
Samuel Jean a collaboré en tant qu'assistant avec des chefs tels que Myung-Wung Chung, Ton Koopman, Friedman Layer, Jean-Christophe Spinosi, David Stern, Laurence Equilbey, Miquel Ortega, Oswald Sallaberger, Hervé Niquet, Fayçal Karoui ou Alain Altinoglu et avec divers metteurs en scène (Jérôme Savary, Chen Shi-Zheng, Lukas Hemleb, Emilio Sagi, Jean Paul Scarpitta, Ludovic Lagarde, Fanny Ardant, Robert Fortune, Jean-Louis Martin-Barbaz…).
Depuis 2004, Samuel Jean est directeur artistique du Festival des "Pierres Lyriques en Béarn des Gaves".
Samuel Jean est depuis septembre 2005 professeur des Ensembles Vocaux au C.N.S.M. (Conservatoire National) de Paris.